Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSH2Q76I76 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSH2Q76I76 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH2Q76I76 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSH2Q76I76 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms