Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
XIRP1Q702N8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
XIRP1Q702N8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP1Q702N8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms