Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms