Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO3Q6UWJ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO3Q6UWJ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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