Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRAIDQ6UW56 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms