Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC41PQ6P2S7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms