Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLFN12LQ6IEE8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN12LQ6IEE8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms