Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD5Q6GMV2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMYD5Q6GMV2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms