Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNF123Q5XPI4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms