Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF4Q5VUM1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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