Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C12orf60Q5U649 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C12orf60Q5U649 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms