Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC18Q5T9S5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC18Q5T9S5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC18Q5T9S5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms