Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms