Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RFTN2Q52LD8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RFTN2Q52LD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms