Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A12Q504Y0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A12Q504Y0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms