Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P3H1Q32P28 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P3H1Q32P28 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P3H1Q32P28 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P3H1Q32P28 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P3H1Q32P28 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P3H1Q32P28 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P3H1Q32P28 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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