Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q1T7F1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q1T7F1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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