Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM187BQ17R55 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM187BQ17R55 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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