Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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