Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACKR1Q16570 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms