Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNXAQ16473 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TNXAQ16473 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TNXAQ16473 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TNXAQ16473 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TNXAQ16473 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNXAQ16473 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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