Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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CNGA3Q16281 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA3Q16281 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CNGA3Q16281 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA3Q16281 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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