Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIP13Q15645 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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