Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP1Q15431 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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