Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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