Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDK3Q15120 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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