Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms