Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEPT6Q14141 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEPT6Q14141 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms