Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA1CQ13936 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms