Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAMK2DQ13557 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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