Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EIF4EBP1Q13541 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EIF4EBP1Q13541 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms