Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATMQ13315 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
ATMQ13315 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATMQ13315 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATMQ13315 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATMQ13315 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATMQ13315 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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