Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXD4Q12950 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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