Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TRAF2Q12933 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF2Q12933 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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