Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMAN2Q12907 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMAN2Q12907 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMAN2Q12907 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMAN2Q12907 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMAN2Q12907 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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