Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 PFK26YIL107C 2484 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ASI3YNL008C 2031 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 SHQ1YIL104C 1524 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 FLO9YAL063C 3969 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 AEP1YMR064W 1557 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YDR115WYDR115W 318 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 MET32YDR253C 576 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 BRR6YGL247W 594 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YKL069WYKL069W 543 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ENV10YLR065C 546 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ARC18YLR370C 537 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YOR203WYOR203W 354 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 snR41snR41 95 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 SHG1YBR258C 429 nt3.84□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 CCM1YGR150C 2595 nt3.84□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 ANR2YKL047W 1551 nt3.84□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 ARG2YJL071W 1725 nt3.84□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 VIP1YLR410W 3441 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 BCD1YHR040W 1101 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 RPL16AYIL133C 600 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 ASG7YJL170C 630 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 PIR1YKL164C 1026 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 RPS28BYLR264W 204 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 UBP16YPL072W 1500 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 MNT4YNR059W 1743 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 SKO1YNL167C 1944 nt3.83□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YDL050CYDL050C 372 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 OPI6YDL096C 327 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 TDA2YER071C 381 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 RPL9AYGL147C 576 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 SPT4YGR063C 309 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 CDC123YLR215C 1083 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 GRE2YOL151W 1029 nt3.82□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 ATP25YMR098C 1839 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 GRX2YDR513W 432 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 HUR1YGL168W 333 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 AGE2YIL044C 897 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YLR171WYLR171W 390 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 BET5YML077W 480 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YNR021WYNR021W 1215 nt3.81□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 LST4YKL176C 2487 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 VPS9YML097C 1356 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 RSM24YDR175C 960 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 NTF2YER009W 378 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 IRC19YLL033W 693 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YLR416CYLR416C 399 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YBL028CYBL028C 321 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 GPI15YNL038W 690 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 HRD1YOL013C 1656 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 SPA2YLL021W 4401 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 FUS2YMR232W 2034 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 MSR1YHR091C 1932 nt3.8□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 SNT1YCR033W 3681 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YGR237CYGR237C 2358 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YDR193WYDR193W 399 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 HTA1YDR225W 399 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 SLD5YDR489W 885 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YEL075CYEL075C 369 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YHL026CYHL026C 948 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 VPS51YKR020W 495 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 SDO1YLR022C 753 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 RNH203YLR154C 333 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YKE2YLR200W 345 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YBL071CYBL071C 309 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 HHF1YBR009C 312 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YPL107WYPL107W 747 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 TPO5YKL174C 1857 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YNR063WYNR063W 1824 nt3.79□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 STU1YBL034C 4542 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 GAL80YML051W 1308 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 STE23YLR389C 3084 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 GLC7YER133W 939 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YGR039WYGR039W 312 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 ACF4YJR083C 930 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 CMD1YBR109C 444 nt3.78□□□□□ -1.8
CLF1Q12309 YAK1YJL141C 2424 nt3.78□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 NUP60YAR002W 1620 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 PSP1YDR505C 2526 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 MTR4YJL050W 3222 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 EXO5YBR163W 1758 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 BNA7YDR428C 786 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YER079WYER079W 633 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 RPI1YIL119C 1224 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 TPM2YIL138C 486 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YIR020CYIR020C 303 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 CSE4YKL049C 690 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 HRI1YLR301W 735 nt3.77□□□□□ -1.81
CLF1Q12309 YNL058CYNL058C 951 nt3.77□□□□□ -1.81
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