Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC173Q0VFZ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms