Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SYCNQ0VAF6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SYCNQ0VAF6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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