Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID5AQ03989 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms