Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 YDR209CYDR209C 414 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 HTA1YDR225W 399 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YDR248CYDR248C 582 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 PEA2YER149C 1263 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YGR053CYGR053C 852 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 EFG1YGR271C-A 702 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NNT1YLR285W 786 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 BET5YML077W 480 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 MIC27YNL100W 705 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 AAR2YBL074C 1068 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YNR062CYNR062C 984 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 HHF1YBR009C 312 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 MUD1YBR119W 897 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SHG1YBR258C 429 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YCL002CYCL002C 792 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 AGE1YDR524C 1449 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RTT10YPL183C 3042 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 PRP8YHR165C 7242 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SKT5YBL061C 2091 nt2.64□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 COBQ0105 1158 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SPT2YER161C 1002 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SEC4YFL005W 648 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YFL015CYFL015C 495 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 MIG2YGL209W 1149 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YLR416CYLR416C 399 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YNL276CYNL276C 396 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 KAR4YCL055W 1008 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YGR067CYGR067C 2415 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 ESA1YOR244W 1338 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 VBA4YDR119W 2307 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 IKI3YLR384C 4050 nt2.63□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 ITT1YML068W 1395 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SEC26YDR238C 2922 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 DNA2YHR164C 4569 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 PIG2YIL045W 1617 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YPL150WYPL150W 2706 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YEL075CYEL075C 369 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 MND1YGL183C 660 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 BRR6YGL247W 594 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RPL14BYHL001W 417 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 LIN1YHR156C 1023 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 CKA1YIL035C 1119 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YIL174WYIL174W 228 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NNF1YJR112W 606 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 VMA5YKL080W 1179 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 PRM6YML047C 1059 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YMR187CYMR187C 1296 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 HBT1YDL223C 3141 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NDC80YIL144W 2076 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NOP56YLR197W 1515 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NGG1YDR176W 2109 nt2.62□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NSA1YGL111W 1392 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RAV2YDR202C 1056 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SMT3YDR510W 306 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 VAB2YEL005C 849 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 UPF3YGR072W 1164 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YGR226CYGR226C 210 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 GOS1YHL031C 672 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YKL115CYKL115C 393 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 ATG38YLR211C 681 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 JIP3YLR331C 378 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YLR400WYLR400W 474 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YPR053CYPR053C 456 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RXT2YBR095C 1293 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 CHS3YBR023C 3498 nt2.61□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 CTF13YMR094W 1437 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RPO41YFL036W 4056 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 ARP5YNL059C 2268 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NSE4YDL105W 1209 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 MFA1YDR461W 111 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 LOC1YFR001W 615 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 PRE4YFR050C 801 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 EMC4YGL231C 573 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YGR039WYGR039W 312 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 GIM5YML094W 492 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 HHF2YNL030W 312 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 ATP11YNL315C 957 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 GIN4YDR507C 3429 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 SHE9YDR393W 1371 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 VPS9YML097C 1356 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 HRD1YOL013C 1656 nt2.6□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 AXL1YPR122W 3627 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 CIN1YOR349W 3045 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 NAB3YPL190C 2409 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 MDV1YJL112W 2145 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 RPN3YER021W 1572 nt2.59□□□□□ -1.99
VHS1Q03785 YDL163WYDL163W 303 nt2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 141.8 ms