Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTBN1Q01082 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms