Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP6V0D1P61421 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP6V0D1P61421 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms