Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX17P56962 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX17P56962 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STX17P56962 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX17P56962 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX17P56962 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX17P56962 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX17P56962 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX17P56962 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX17P56962 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX17P56962 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX17P56962 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX17P56962 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX17P56962 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX17P56962 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX17P56962 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX17P56962 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX17P56962 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms