Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTTPP55157 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTTPP55157 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTTPP55157 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTTPP55157 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTTPP55157 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTTPP55157 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MTTPP55157 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MTTPP55157 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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