Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HADHBP55084 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HADHBP55084 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HADHBP55084 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HADHBP55084 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HADHBP55084 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HADHBP55084 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HADHBP55084 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HADHBP55084 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms