Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD23BP54727 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD23BP54727 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms