Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNA2P51530 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNA2P51530 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNA2P51530 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNA2P51530 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNA2P51530 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNA2P51530 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNA2P51530 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNA2P51530 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms