Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRE11P49959 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRE11P49959 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRE11P49959 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRE11P49959 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRE11P49959 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRE11P49959 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRE11P49959 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms