Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP2P42575 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP2P42575 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP2P42575 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP2P42575 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP2P42575 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms