Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4A3P38919 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms